朱温安顿好昭宗李晔,便开始东征,攻打青州。平卢节度使王师范知道打不过朱温,比划了几下,便投降了,朱温将胶东半岛收入囊中。为了更好地控制昭宗,朱温强行把昭宗“请”到了洛阳。行前昭宗哭着对给他送行的人群说:“‘纥干山头冻杀雀,何不飞去生处乐’,朕今到处流浪,不知道会死在哪里!”众人莫不掩面而哭。
不过唐昭宗李晔也留了一手,行前他秘拟了一道旨意,分道送给河东的李克用、西川的王建、淮南的杨行密,让他们有朝一日除掉朱温,恢复唐朝。不久,王建、李茂贞、李克用、杨行密等人公开声讨朱温,说朱温大逆不道。朱温本想讨伐这些藩镇,但又怕各藩镇借昭宗威望联合起来攻打自己,于是便有了杀掉昭宗的想法。
唐天祐元年(904年)八月,朱温派遣朱友恭、氏叔琮等人前往洛阳杀死昭宗,昭宗享年38岁。当昭宗死讯传来,朱温痛哭流涕,说一定要为先帝报仇雪恨,结果又把“首逆”朱友恭杀了。之后,朱温强行推立年仅13岁的辉王李柷为皇帝,这也是唐朝最后一个皇帝——唐哀帝。