查士丁尼派遣军队讨伐西方的野蛮人王国,征战意大利、北非、西班牙各地,收复了原属于西罗马帝国的大部分领土。东罗马帝国在西方的胜利进军,引起了波斯人的不安。他们害怕东罗马帝国在西方的势力增强后,会把矛头转向东方。公元540年,波斯撕毁“永久和平”协议,向东罗马帝国宣战。公元541—544年,贝利萨留再次率军对波斯作战,打了几场胜仗,但因为对纪律松弛的雇佣军控制不力,被查士丁尼斥为不忠,剥夺了他的军权。幸亏皇后干预,贝利萨留才免于身败名裂。正在此时,意大利的东哥特人再次反叛,贝利萨留于公元544年再次率军征讨意大利。长期的征战,使得征讨意大利的部队疲惫不堪,加上查士丁尼心存猜忌,对贝利萨留屡次的求援不予理睬,结果造成对东哥特人的征战失利。公元548年,贝利萨留被召回君士坦丁堡,解除职务。公元559年,匈奴人入侵,他再次被皇帝任用,率军击退匈奴人。
公元562年,贝利萨留被指控参与谋反,家产被抄,本人还被投进监狱。他次年获释,出狱不久便去世了。
贝利萨留极善于用兵,他打的仗,基本上都是以弱势的兵力战胜强敌,这一点非常难得,无愧于名将的称号。他戎马一生,英勇善战,忠心耿耿,为拜占庭帝国立下赫赫战功,只是因为皇帝的猜忌,被召回,被解职,受冷遇,如此反复,他的地位越来越低。他的遭遇确实让人唏嘘不已。