查士丁尼派遣军队讨伐西方的野蛮人王国，征战意大利、北非、西班牙各地，收复了原属于西罗马帝国的大部分领土。东罗马帝国在西方的胜利进军，引起了波斯人的不安。他们害怕东罗马帝国在西方的势力增强后，会把矛头转向东方。公元540年，波斯撕毁“永久和平”协议，向东罗马帝国宣战。公元541—544年，贝利萨留再次率军对波斯作战，打了几场胜仗，但因为对纪律松弛的雇佣军控制不力，被查士丁尼斥为不忠，剥夺了他的军权。幸亏皇后干预，贝利萨留才免于身败名裂。正在此时，意大利的东哥特人再次反叛，贝利萨留于公元544年再次率军征讨意大利。长期的征战，使得征讨意大利的部队疲惫不堪，加上查士丁尼心存猜忌，对贝利萨留屡次的求援不予理睬，结果造成对东哥特人的征战失利。公元548年，贝利萨留被召回君士坦丁堡，解除职务。公元559年，匈奴人入侵，他再次被皇帝任用，率军击退匈奴人。
公元562年，贝利萨留被指控参与谋反，家产被抄，本人还被投进监狱。他次年获释，出狱不久便去世了。
贝利萨留极善于用兵，他打的仗，基本上都是以弱势的兵力战胜强敌，这一点非常难得，无愧于名将的称号。他戎马一生，英勇善战，忠心耿耿，为拜占庭帝国立下赫赫战功，只是因为皇帝的猜忌，被召回，被解职，受冷遇，如此反复，他的地位越来越低。他的遭遇确实让人唏嘘不已。